Sus orígenes datan de la creación de Club FEM Biobío fundado en 2015 por Cristian Ferrer y Alfonso Bastías, quienes emigraron de Fernández Vial tras su desafiliación en 2014, sumado a un grupo jugadoras de dicho club. Debido a la exigencia por parte de la ANFP de estar federados para competir decidieron buscar un club que los amparara, es así como llegaron a la Universidad de Concepción, presentaron el proyecto y se convirtieron en la rama del Club en enero de 2016, donde tienen su primera incursión en el campeonato de apertura. En 2018, de la mano del entrenador y ayudante técnico Nilson Concha obtiene
buen rendimiento llegando a cuartos de final, perdiendo frente a Colo Colo. El 2021 fue un año de crecimiento y solidez para Universidad de Concepción. A
una inédita campaña, que les permitió entra a fase de Play Offs, donde fueron eliminadas por las que finalmente serían las campeonas Universidad de Chile, se
le suma la constante convocatoria de jugadoras a los micro ciclos de la Selección Chilena, la utilización indiscutida del estadio Ester Roa Rebolledo para sus partidos
y ser gestores de unas de las más destacadas transmisiones televisivas de sus partidos.
